故事早期，二年级前的暑假
最糟糕的生日
哈利·波特在女贞路德思礼家度过了一个悲惨的夏天。他的十二岁生日没有收到姨妈、姨父或表哥的任何祝福，也没有收到好友罗恩·韦斯莱和赫敏·格兰杰的来信。德思礼一家正在为一位富有的客户准备晚宴，哈利被命令待在房间里，假装自己不存在。感到孤独并与魔法世界隔绝的哈利坐在花园里，对自己唱着“生日快乐”，却遭到表哥达力的嘲笑。这一天是低谷，凸显了哈利的孤立以及他对重返霍格沃茨魔法学校的渴望。
哈利生日当晚，德思礼家晚宴期间
多比的警告
当德思礼一家在楼下招待客人时，一个奇怪的生物出现在哈利的卧室里。这个生物自称多比，是一个家养小精灵，并透露整个夏天他一直在截取哈利朋友们的来信，以阻止他返回霍格沃茨。多比警告哈利，学校正在酝酿一个可怕的阴谋，如果他回去将面临致命危险。尽管哈利试图获取更多信息，但多比每次接近透露阴谋时都会惩罚自己。这次遭遇以灾难告终：多比用魔法把布丁掉在地上，嫁祸给哈利。德思礼一家勃然大怒，把哈利锁在房间里，窗户上加了铁条，哈利还收到了魔法部关于未成年魔法的正式警告，尽管他并没有施法。
哈利生日几天后，深夜
女贞路营救
哈利被困在房间里，饥饿而绝望，这时他惊讶地看到罗恩·韦斯莱的脸出现在窗外。罗恩和他的双胞胎兄弟弗雷德和乔治一起，开着父亲亚瑟·韦斯莱的魔法飞车福特安格里亚来救他。韦斯莱一家帮哈利拆下窗户上的铁条，并从德思礼家取回他的行李箱和猫头鹰海德薇。弗农姨父试图阻止他们，但哈利及时被拉进车里。汽车飞入夜空，哈利终于自由了，向德思礼一家大喊告别。这次营救是一个转折点，标志着哈利从悲惨的夏天过渡到在韦斯莱家陋居的快乐时光。
开学前的一个月
陋居生活
哈利来到陋居，韦斯莱家混乱而神奇的家，与德思礼家井然有序的房子形成鲜明对比。莫丽·韦斯莱夫人热情地欢迎他，对他嘘寒问暖，亚瑟·韦斯莱先生则对麻瓜物品着迷。哈利帮忙给花园拔地精，认识了罗恩的妹妹金妮，她见到哈利很害羞，还了解了魔法世界的奇闻，比如会说话的镜子和阁楼里的食尸鬼。这个月是哈利一生中最快乐的时光，充满了美食、欢笑和归属感。他还收到了霍格沃茨的来信，其中包括一份以新黑魔法防御术教师吉德罗·洛哈特的作品为主的书单。
夏末的一个星期三，开学前
对角巷购物
韦斯莱一家和哈利通过飞路粉前往对角巷购买学习用品。哈利与大家走散，意外来到了翻倒巷，一条黑暗危险的街道，两旁商店出售黑魔法物品。他躲在博金-博克商店里，无意中听到卢修斯·马尔福向店主出售可疑物品。海格救出哈利，带他回到对角巷，与韦斯莱一家团聚，并遇到了赫敏·格兰杰和她的父母。一行人参观了古灵阁巫师银行，哈利看到韦斯莱家微薄的金库，对自己的财富感到内疚。这一天在丽痕书店达到高潮，吉德罗·洛哈特隆重登场，宣布他的新教职，并强迫与哈利合影，令哈利十分尴尬。
对角巷购物当天
丽痕书店的对峙
洛哈特宣布之后，韦斯莱一家和哈利在丽痕书店遇到了马尔福一家。德拉科·马尔福嘲笑罗恩家贫穷，卢修斯·马尔福则侮辱亚瑟·韦斯莱的工作，并称格兰杰一家是麻瓜。紧张局势升级为亚瑟和卢修斯之间的肢体冲突，海格上前制止。在混乱中，卢修斯把金妮·韦斯莱的旧变形课课本偷偷塞回她的坩埚里，这个看似微不足道的举动将产生重大后果。这次事件让韦斯莱一家感到羞辱和愤怒，哈利对马尔福一家产生了深深的敌意。这次对峙凸显了阶级和血统的紧张关系，这些紧张关系将推动本学年的许多冲突。
9月1日，开学日
飞车事件
哈利和罗恩无法穿过国王十字车站的9¾站台屏障，错过了霍格沃茨特快列车。为了不错过开学，罗恩决定驾驶他父亲的魔法福特安格里亚飞往霍格沃茨。旅程起初令人兴奋，但接近学校时汽车开始出现故障。他们撞上了打人柳，一棵暴力的魔法树，它攻击了汽车。汽车将他们和行李弹出，然后驶入禁林。哈利和罗恩，带着瘀伤和惊吓，走向城堡，被西弗勒斯·斯内普抓住，带到麦格教授和阿不思·邓布利多面前。他们没有被开除，但受到了禁闭和严厉警告。
飞车事件后的第二天早上
韦斯莱夫人的吼叫信
在大礼堂吃早餐时，罗恩收到了母亲莫丽·韦斯莱的吼叫信。这封魔法信以韦斯莱夫人被魔法放大的声音对他尖叫，表达了她对偷车事件以及他和哈利所冒危险的愤怒和担忧。吼叫信还透露亚瑟·韦斯莱因这件事正面临工作上的调查。罗恩羞愧难当，整个礼堂都听到了责骂，哈利也为给韦斯莱家带来麻烦而感到内疚。这一事件起到了公开惩罚的作用，提醒他们鲁莽行为的后果，但也为事件画上了句号。
学期初，第一节黑魔法防御术课
洛哈特的第一课
吉德罗·洛哈特的第一节课是一场灾难。他给全班做了一个关于他自己生活和成就的测验，然后放出一笼康沃尔郡小精灵，它们立刻造成混乱。小精灵摧毁了教室，抓住纳威·隆巴顿的耳朵，还把洛哈特自己的魔杖扔出窗外。洛哈特完全无能，无法控制局面，逃离了教室，留下哈利、罗恩和赫敏去收拾小精灵。这节课揭示了洛哈特作为骗子和冒牌货的真实本质，令学生们沮丧。然而，赫敏仍然对他的书印象深刻，这在她对他书面形象的信任和他实际无能之间建立了冲突。
初秋的一个星期六早上，魁地奇训练期间
泥巴种侮辱
在一次联合魁地奇训练中，德拉科·马尔福侮辱赫敏，称她为“泥巴种”，这是一个对麻瓜出身女巫极具冒犯性的词。罗恩愤怒地用他破损的魔杖试图诅咒马尔福，但咒语反弹，导致罗恩呕吐出鼻涕虫。这一事件凸显了对麻瓜出身者的深层偏见，并为学年核心冲突埋下伏笔。哈利和赫敏带罗恩去海格的小屋，海格解释了这个词的含义并表达了愤怒。这一事件还引入了斯莱特林继承人针对麻瓜出身者的想法，因为针对学生的攻击即将开始。
万圣节之夜
忌辰晚会与首次攻击
哈利、罗恩和赫敏参加了差点没头的尼克在地下室举办的五百周年忌辰晚会，这是一个阴森的活动，充满了幽灵和腐烂的食物。他们提前离开，在走廊里，哈利听到一个只有他能听到的、无形的、充满杀意的声音。循着声音，他们发现墙上写着：“密室已被打开，继承人的敌人，当心。”在文字下方挂着阿格斯·费尔奇的猫洛丽丝夫人，被石化了，僵硬如板。三人被发现在现场，德拉科·马尔福指责哈利是斯莱特林的继承人。这次攻击标志着将恐吓学校的一系列神秘事件的开始。
首次攻击几天后，魔法史课上
密室的传说
在赫敏的提问下，宾斯教授不情愿地给全班讲了密室的传说。他解释说，霍格沃茨是一千多年前由四位伟大的巫师创立的：戈德里克·格兰芬多、赫尔加·赫奇帕奇、罗伊纳·拉文克劳和萨拉查·斯莱特林。斯莱特林认为只应教授纯血统巫师，在分歧后离开了学校，但据说建造了一个隐藏的密室。传说只有斯莱特林真正的继承人才能打开密室，释放怪物来清除学校里的麻瓜出身者。宾斯教授认为这个故事是无稽之谈，但学生们深感不安，这个传说成为本学年的核心谜团。
初秋的一个星期六，格兰芬多对斯莱特林魁地奇比赛期间
失控的游走球
在本赛季第一场魁地奇比赛中，一个失控的游走球不断攻击哈利，似乎被附身了。弗雷德和乔治·韦斯莱试图保护他，但游走球明显被施了魔法，只针对哈利。尽管危险，哈利还是单手抓住了金色飞贼，为格兰芬多赢得了比赛，但过程中他的手臂骨折了。吉德罗·洛哈特试图治疗手臂，却反而移除了所有骨头，使手臂软塌塌的。哈利被送到医院侧翼，必须一夜之间重新长出骨头。后来揭示这一事件是多比试图让哈利被送回家，因为家养小精灵给游走球施了魔法，以保护他免受霍格沃茨的危险。
圣诞节前一周，第一次决斗俱乐部会议期间
决斗俱乐部事件
吉德罗·洛哈特和西弗勒斯·斯内普为学生创办了决斗俱乐部。在一次示范中，洛哈特被斯内普轻松解除武器。当学生们配对练习时，斯内普将哈利与德拉科·马尔福配对。马尔福用乌龙出洞咒语召唤出一条蛇，威胁到赫奇帕奇学生贾斯廷·芬列里。哈利不假思索地用蛇佬腔对蛇说话，命令它离开贾斯廷。蛇服从了，但人群惊恐万分，因为蛇佬腔是一种罕见而黑暗的能力，与萨拉查·斯莱特林有关。这一事件助长了哈利是斯莱特林继承人的谣言，贾斯廷和许多其他学生都对他感到恐惧。哈利现在被广泛怀疑是攻击的幕后黑手。
决斗俱乐部事件几天后，一个下雪天
第二次攻击
决斗俱乐部事件后，哈利感到孤立，无意中听到赫奇帕奇学生讨论他们认为他是斯莱特林继承人。后来，他发现贾斯廷·芬列里和差点没头的尼克都在走廊里被石化了。贾斯廷冻僵了，尼克不再是珍珠白色，而是黑色和烟熏状，被怪物的凝视全力击中。皮皮鬼发出警报，哈利被发现在现场，进一步牵连自己。他被带到邓布利多的办公室，在那里第一次遇到了凤凰福克斯。邓布利多询问了哈利，但没有指责他，而是给出了一个神秘的保证：“霍格沃茨永远会帮助那些需要帮助的人。”
圣诞节前的几周
复方汤剂计划
为了证明德拉科·马尔福是斯莱特林的继承人，赫敏制定了一个计划，使用复方汤剂变成斯莱特林的学生去盘问他。她、哈利和罗恩从斯内普的私人储藏室偷了必要的原料，并在魔药课上制造了混乱作为掩护。他们在哭泣的桃金娘卫生间熬制魔药，那是一个秘密且安全的地点。这个计划很冒险，需要他们从目标身上获取头发：克拉布、高尔和米里森·伯斯德。魔药需要一个月才能准备好，三人焦急地等待它完成，希望能最终揭开袭击背后的真相。
圣诞夜
圣诞夜的复方汤剂行动
圣诞夜，哈利、罗恩和赫敏执行了他们的复方汤剂计划。他们成功用掺了安眠药的蛋糕迷晕了克拉布和高尔，并偷了他们的头发。喝下魔药后，哈利和罗恩分别变成了高尔和克拉布，但赫敏的变形出了问题，因为她用了猫毛而不是米里森·伯斯德的头发，结果长出了毛茸茸的脸和尾巴。伪装后的哈利和罗恩潜入斯莱特林公共休息室，盘问了德拉科·马尔福。然而，马尔福透露自己并非斯莱特林的继承人，也不知道是谁，但他吹嘘说他的父亲知道上次密室开启的事。这次任务部分失败，但他们得知斯莱特林的继承人仍然逍遥法外。
二月初，复方汤剂事件之后
汤姆·里德尔的日记
哈利和罗恩在哭泣的桃金娘卫生间发现了一本湿漉漉的空白日记，它是被扔向桃金娘的。这本日记有五十年历史，上面写着T. M.里德尔的名字。哈利拿走了它，经过尝试，他发现可以通过文字与日记的主人汤姆·里德尔交流。里德尔透露，他就是五十年前抓住那个打开密室的人，并主动提出让哈利看看那段记忆。哈利同意了，日记将他拉入一段生动的过去记忆，他目睹了里德尔指控海格是斯莱特林的继承人，并放出了怪物。这段记忆似乎证实了海格有罪，动摇了哈利对朋友的信任。
第二次袭击几天后，晚春时节
海格被捕与邓布利多停职
赫敏和佩内洛·克里瓦特被石化后，魔法部在康奈利·福吉的带领下抵达霍格沃茨逮捕海格，认为他是袭击的元凶。卢修斯·马尔福也出现了，并出示了一份由校董签署的停职令，迫使邓布利多辞去校长职务。海格被带往阿兹卡班，但离开前，他神秘地告诉哈利和罗恩“跟着蜘蛛走”就能找到真相。邓布利多的离开让学校陷入恐惧和混乱，麦格教授暂时接管。哈利和罗恩现在只能靠自己解开谜团，拯救学校。
海格被捕几天后的夜晚
拜访阿拉戈克
按照海格的神秘线索，哈利和罗恩在夜晚冒险进入禁林跟随蜘蛛。他们被一群巨型蜘蛛——八眼巨蛛——抓住，并被带到它们的首领阿拉戈克面前。阿拉戈克是海格的老朋友，他透露自己并非密室的怪物，而且五十年前海格是无辜的。他告诉他们，真正的怪物是蜘蛛最害怕的东西，但他拒绝说出名字。随后蜘蛛试图杀死哈利和罗恩，但他们被韦斯莱家的飞车救下，那辆车一直在森林里野生。逃脱过程惊险万分，但他们获得了关键信息：怪物不是阿拉戈克，而且它曾导致一个女孩在卫生间死亡。
拜访阿拉戈克的第二天，在医院侧翼
蛇怪真相揭露
哈利和罗恩去医院侧翼看望被石化的赫敏，发现她手里攥着一本旧图书馆书的书页。书页描述了蛇怪，一种目光致命的巨蛇，并注明蜘蛛会逃离它。赫敏还在底部写了“管道”一词。哈利意识到密室的怪物是蛇怪，这解释了他为什么能听到它的声音（作为蛇佬腔），而其他人听不到。蛇怪一直通过学校的管道系统移动。这个发现也解释了为什么受害者被石化而非杀死：他们间接看到了蛇怪，通过倒影、相机或幽灵。三人组现在知道了他们面对的是什么。
蛇怪真相揭露的同一天，傍晚
金妮被掳
就在哈利和罗恩准备报告他们的发现时，麦格教授宣布又有一名学生被带入了密室：金妮·韦斯莱。斯莱特林的继承人留下了一条新信息：“她的尸骨将永远留在密室。”学校陷入恐慌，教师们决定第二天将所有学生送回家。哈利和罗恩悲痛欲绝，知道金妮性命攸关。他们决定自己动手，去找吉德罗·洛哈特，他们认为他是唯一可能知道如何找到密室的老师。这次绑架将风险推到了最高点，迫使哈利采取行动。
金妮被掳的当晚
与洛哈特对峙
哈利和罗恩去洛哈特的办公室要求他帮忙，却发现他正在打包准备逃离学校。洛哈特承认自己是个骗子，一直冒领其他巫师的功劳并抹去他们的记忆。他试图对哈利和罗恩使用记忆咒，但哈利用“除你武器”咒语缴了他的械。被迫合作后，洛哈特被押到哭泣的桃金娘卫生间，哈利用蛇佬腔打开了密室的入口：一个藏在洗手池下方的管道。三人组带着洛哈特，准备进入黑暗去营救金妮并面对怪物。
同一天晚上，打开入口后立即
进入密室
哈利、罗恩和洛哈特滑下那条黑暗、黏滑的管道，它通向霍格沃茨深处，最终落在一个石头隧道里。他们沿着隧道前进，隧道里散落着小动物的骨头，直到他们遇到一张巨大的蜕下的蛇皮，证实了蛇怪的存在。洛哈特抓住机会，偷走了罗恩的魔杖，试图对他们施放记忆咒，但咒语因罗恩损坏的魔杖而反噬，导致隧道塌方，将哈利与罗恩和洛哈特分开。哈利现在独自一人，被迫继续深入密室，去面对蛇怪并拯救金妮。分离加剧了紧张气氛，为哈利的单独对决埋下了伏笔。
同一天晚上，密室内部
与汤姆·里德尔对峙
哈利进入主密室，发现金妮一动不动地躺在萨拉查·斯莱特林的巨大雕像脚下。汤姆·里德尔以日记中的记忆形式出现，与他正面对峙。里德尔透露他就是伏地魔，那个杀害哈利父母的黑魔王，并且他一直通过日记控制金妮，迫使她打开密室并实施袭击。里德尔召唤蛇怪来杀死哈利，但凤凰福克斯赶到，带来了分院帽，帽中藏着戈德里克·格兰芬多的宝剑。福克斯啄瞎了蛇怪，哈利用剑杀死了它。然而，哈利被蛇怪的一颗毒牙刺中，似乎快要死了。
同一天晚上，蛇怪死后立即
摧毁日记
当哈利因蛇怪毒液而濒死时，福克斯在他的伤口上哭泣，它的眼泪完全治愈了哈利。汤姆·里德尔现在变得脆弱，试图杀死哈利，但福克斯将日记丢到哈利腿上。哈利意识到日记是里德尔力量的关键，便用一颗蛇怪毒牙刺穿了它。日记被摧毁，里德尔的记忆也随之消散，尖叫着消失。金妮醒来，哈利安慰她，告诉她里德尔已经走了。日记的摧毁打破了伏地魔对金妮的控制，终结了密室的威胁。随后，福克斯将哈利、金妮和昏迷的洛哈特救出，飞回了管道上方。
同一天晚上，在麦格教授的办公室
后续与真相揭露
哈利、罗恩、金妮和洛哈特从密室出来，被带到麦格教授的办公室，邓布利多已经回来了。哈利解释了发生的一切，包括日记的作用以及里德尔的真实身份是伏地魔。邓布利多透露，伏地魔在试图杀死哈利的那晚，将部分力量转移到了哈利身上，这就是为什么哈利会说蛇佬腔。他还告诉哈利，分院帽把他分到格兰芬多是因为他选择了那里，并强调“我们的选择远比我们的能力更能表明我们是什么样的人”。哈利为格兰芬多赢得了两百分，学校举行了庆祝宴会。
同一天晚上，宴会之后
多比获释
卢修斯·马尔福冲进邓布利多的办公室，对邓布利多的回归感到愤怒。邓布利多透露其他校董已经恢复了他的职位，马尔福的阴谋已被揭穿。哈利意识到多比是马尔福的家养小精灵，便设计让马尔福给了多比一只袜子，根据家养小精灵的法律，这使他获得了自由。多比欣喜若狂，并用他新获得的自由保护哈利，将马尔福扔下了楼梯。马尔福狼狈地离开，多比向哈利连连道谢。释放多比是哈利的胜利时刻，他不仅拯救了金妮和学校，还解放了一个被奴役的生命。多比的自由象征着马尔福家族黑暗影响的失败。
学年的最后一天
学年末宴会
学年以在大礼堂举行的庆祝宴会结束。被石化的受害者，包括赫敏、科林·克里维和贾斯廷·芬列里，被曼德拉草复活药剂救醒。海格从阿兹卡班归来，学校充满了喜悦和宽慰。邓布利多宣布取消考试作为学校的奖励，这让赫敏很沮丧，并说洛哈特因失忆不会回来了。格兰芬多连续第二年赢得学院杯，这要归功于哈利和罗恩的四百分。宴会是一个结束和庆祝的时刻，标志着一个危险学年的结束和霍格沃茨恢复和平。
学期的最后一天，在霍格沃茨特快列车上
回家的旅程
在返回伦敦的火车上，哈利、罗恩、赫敏、金妮、弗雷德和乔治共享一个隔间，享受假期前最后的魔法时光。他们玩爆炸牌，练习决斗。哈利给了罗恩和赫敏他在德思礼家的电话号码，希望暑假能保持联系。金妮透露珀西有个女朋友，佩内洛·克里瓦特，这解释了他神秘的行为。旅程轻松愉快，与学年开始时形成鲜明对比。当他们穿过屏障回到麻瓜世界时，哈利回顾了他的冒险，并期待未来，他知道自己拥有真正的朋友和一个属于他的地方。
