故事初期，开学前几天
另一位部长会面
麻瓜首相独自在办公室，被一系列无法解释的灾难困扰：一座桥倒塌、两起谋杀、一场反常的飓风，以及他的初级部长赫伯特·乔利的奇怪行为。他被一幅宣布康奈利·福到达的肖像吓了一跳，福是魔法部部长。福通过飞路网出现，并透露这些事件是伏地魔和他的食死徒组织所为。福解释说他已被解职，并介绍他的继任者鲁弗斯·斯克林杰。斯克林杰，一个狮子般的男人，采取强硬立场，告知首相他的秘书实际上是一名被派来保护的傲罗，而乔利处于夺魂咒的控制下。这次会面凸显了日益升级的战争和魔法界的绝望。
另一位部长会面当晚
纳西莎向斯内普恳求
纳西莎·马尔福由她的姐姐贝拉特里克斯·莱斯特兰奇陪同，前往蜘蛛尾巷西弗勒斯·斯内普破败的房子。纳西莎绝望了，担心儿子德拉科·马尔福的生命，因为伏地魔给他分配了一项危险的任务。贝拉特里克斯公开怀疑斯内普的忠诚，但斯内普冷静地为自己辩护，解释了他作为黑魔王间谍的角色。纳西莎恳求斯内普保护德拉科，并在必要时亲自完成任务。斯内普同意了，他们立下牢不可破的誓言，贝拉特里克斯作为见证人。斯内普发誓要照看德拉科，保护他免受伤害，并在德拉科失败时执行任务。
七月底，开学前几周
邓布利多接走哈利
哈利·波特在德思礼家等待，当阿不思·邓布利多出现要带他去陋居时，他感到惊讶。邓布利多透露小天狼星·布莱克把一切都留给了哈利，包括格里莫广场12号和小精灵克利切。他通过命令克利切保持沉默来测试哈利的所有权，这成功了。邓布利多还告诉哈利，他继承了鹰头马身有翼兽巴克比克。离开前，邓布利多警告德思礼一家，哈利的魔法保护只会持续到他十七岁生日，并请求他们允许他最后一次回来。然后哈利和邓布利多幻影移形离开，开始了他们的旅程。
邓布利多接走哈利当晚
说服霍拉斯·斯拉格霍恩
邓布利多带哈利去巴德莱·巴伯顿村，招募前霍格沃茨教授霍拉斯·斯拉格霍恩回来教书。他们发现斯拉格霍恩的房子似乎被洗劫一空，但这是一个诡计；斯拉格霍恩本人正伪装成一把扶手椅躲藏。邓布利多揭穿了他，经过一番交谈，斯拉格霍恩因危险而表示不情愿，但哈利的出现和关于邓布利多保护的话说服他接受了魔药学教授职位。斯拉格霍恩同意了，他们离开了。邓布利多后来向哈利解释，斯拉格霍恩是一个收集有才华和有影响力人物的人，并警告哈利，他会试图把哈利加入他的收藏。
深夜，说服斯拉格霍恩之后
抵达陋居
哈利和邓布利多幻影移形到陋居。他们受到忧心忡忡的莫丽·韦斯莱和情绪低落的尼法朵拉·唐克斯的迎接，唐克斯似乎很沮丧，很快离开了。哈利得知亚瑟·韦斯莱被提升为伪劣防御咒语及防护物品检测没收办公室主任。他还看到了韦斯莱家的家庭钟，所有指针都指向“致命危险”。吃过夜宵后，哈利被送到弗雷德和乔治的房间睡觉，房间里堆满了玩笑商店的产品。他很快睡着了，被当晚的事情弄得筋疲力尽。
哈利抵达陋居后的第二天早上
O.W.L.成绩到达
哈利醒来发现罗恩、赫敏和金妮在他的房间里。他们讨论新老师霍拉斯·斯拉格霍恩，以及芙蓉·德拉库尔的存在，她与比尔·韦斯莱订婚了。金妮和赫敏表达了对芙蓉的厌恶，称她为“黏痰”。谈话被猫头鹰送来的O.W.L.成绩打断。哈利通过了，黑魔法防御术获得“优秀”，魔药学获得“超出预期”，还有其他科目。赫敏获得了十个“优秀”和一个“超出预期”。罗恩也通过了，只不及格占卜学和魔法史。哈利很失望，他的魔药学成绩不够高，无法在斯内普手下继续学习N.E.W.T.级别。
暑假期间的一个星期六，在对角巷购物时
德拉科在翻倒巷的绕道
哈利、罗恩和赫敏在海格的陪同下，去对角巷购物。他们在摩金夫人的长袍店遇到了德拉科·马尔福和他的母亲纳西莎。发生了一场紧张的对抗，纳西莎威胁哈利。后来，哈利发现马尔福独自溜走，便用隐形衣跟着他进入翻倒巷。他们看到马尔福在博金-博克商店威胁博金先生，要求他修理某样东西并保管好另一件物品。马尔福提到芬里尔·格雷伯克是家庭朋友，以确保博金服从。赫敏试图调查但很快被赶了出来。哈利确信马尔福在策划什么邪恶的事。
在霍格沃茨特快列车上，开学第一天
鼻涕虫俱乐部邀请
在去霍格沃茨的火车上，哈利、纳威和卢娜共享一个隔间。罗米达·万尼接近哈利，想和他坐在一起，但被拒绝了。后来，一个三年级女生送来霍拉斯·斯拉格霍恩的邀请，请哈利和纳威去他的隔间吃午饭。哈利、纳威和金妮参加了，遇到了其他学生，如布雷斯·扎比尼、考麦克·麦克拉根和马库斯·贝尔比。斯拉格霍恩询问他们关于著名的亲戚和关系，显然是想为他的“鼻涕虫俱乐部”收集有才华或人脉广的学生。哈利对这种关注感到不舒服，但得知斯拉格霍恩对他感兴趣是因为“被选中的人”的传言。
随后在霍格沃茨特快列车上，鼻涕虫俱乐部午餐后
哈利监视马尔福
午餐后，哈利用隐形衣跟着布雷斯·扎比尼进入斯莱特林隔间，希望能偷听到德拉科·马尔福的谈话。他躲在行李架上，听到马尔福吹嘘自己从黑魔王那里得到了一项任务，并暗示他明年可能不会回霍格沃茨了。马尔福轻视N.E.W.T.的重要性，说黑魔王只关心服务和奉献。当火车到达霍格莫德车站时，马尔福怀疑哈利在场，对他施了统统石化咒，使他从架子上掉下来。然后马尔福踩了哈利的脸，打断了他的鼻子，把他留在隐形衣下。
马尔福把哈利留在火车上之后立即
唐克斯救哈利
当霍格沃茨特快列车开始离开时，尼法朵拉·唐克斯发现了哈利，他仍然瘫痪着，在隐形衣下流血。她解除了他的石化，用咒语修复了他的鼻子。他们一起跳下火车。唐克斯解释说，她被派驻在霍格莫德以提供额外保护。他们走到霍格沃茨的大门，大门被锁链和魔法保护着。唐克斯召唤了帮助，西弗勒斯·斯内普到达，护送哈利去城堡。斯内普对哈利的迟到冷嘲热讽，并扣了格兰芬多的分数。哈利愤怒但保持沉默，他对斯内普的仇恨加深了。
开学宴会，学期第一个晚上
斯内普获胜
哈利迟到，来到大礼堂的开学宴会。邓布利多宣布霍拉斯·斯拉格霍恩将成为新的魔药学教授，而西弗勒斯·斯内普终于要教黑魔法防御术了。哈利很愤怒，因为他曾希望斯拉格霍恩教那门课。然后邓布利多发表了严肃的讲话，谈到伏地魔的回归和加强安全的需要。他敦促学生报告任何可疑情况。斯内普新职位的宣布引起了骚动，哈利发誓斯内普会在年底前离开，因为黑魔法防御术的职位被诅咒了。
学期第一节魔药课
混血王子的书
在斯拉格霍恩的第一节魔药课上，哈利和罗恩没有买新课本，从柜子里拿到了旧书。哈利的书里满是前主人“混血王子”的手写笔记和修改。按照王子的指示，哈利成功熬制了活地狱汤剂，赢得了一瓶福灵剂作为奖品。赫敏对这本书表示怀疑，但哈利为它辩护。后来，哈利发现书上写着“本书为混血王子所有”。他对王子的身份以及写在页边空白处的许多咒语和魔药技巧产生了兴趣。
一个星期六晚上，在哈利与邓布利多的第一次私人课上
冈特时刻
邓布利多开始用冥想盆向哈利展示伏地魔过去的记忆。他们首先看到一个记忆，魔法部官员鲍勃·奥格登拜访冈特一家。冈特家族是萨拉查·斯莱特林的最后后裔，生活在贫困和肮脏中。介绍了马沃罗·冈特、他的儿子莫芬·冈特和他的女儿梅洛普·冈特。莫芬袭击了一个麻瓜，老汤姆·里德尔，后来被捕。记忆显示梅洛普爱上了这个麻瓜，她是伏地魔的母亲。邓布利多解释说，梅洛普用迷情药诱骗了老汤姆·里德尔，但当她停止使用时，他抛弃了她。她在孤儿院生下小汤姆·里德尔后不久就去世了。
学期开始几周后，在魁地奇选拔赛期间
赫敏的援手
哈利为格兰芬多队举行魁地奇选拔赛。考麦克·麦克拉根作为守门员表现出色，但罗恩在赫敏暗中帮助下（她混淆了麦克拉根），扑出了五个罚球，赢得了这个位置。哈利选择了金妮、凯蒂·贝尔和德梅尔扎·罗宾斯作为追球手，吉米·佩克斯和里切·库特作为击球手。后来，哈利、罗恩和赫敏去看望海格，他因为她们放弃了保护神奇生物课而难过。他还担心他的宠物蜘蛛阿拉戈克，它快要死了。他们安慰了他，这次访问以更好的气氛结束。哈利还告诉韦斯莱先生他对马尔福的怀疑，但韦斯莱先生表示怀疑。
十月份的一个霍格莫德周末
银器和蛋白石
在去霍格莫德的一次旅行中，哈利、罗恩和赫敏遇到了蒙顿格斯·弗莱奇，他正在出售从小天狼星家偷来的物品。哈利质问他，但蒙顿格斯幻影移形了。后来，在回霍格沃茨的路上，他们目睹凯蒂·贝尔被一条诅咒的蛋白石项链诅咒。她升到空中，尖叫着，然后倒下了。哈利、罗恩和赫敏帮忙，哈利用围巾盖住了项链。他们向麦格教授报告了这件事，她对哈利关于德拉科·马尔福是幕后黑手的理论表示怀疑，因为马尔福当时正在和她一起关禁闭。这次袭击显然是试图将一件致命物品偷运进学校。
一个周一的晚上，哈利与邓布利多的第二次私人课程期间
里德尔的秘密
邓布利多向哈利展示了另一段记忆：他亲自访问了汤姆·里德尔长大的伍氏孤儿院。年轻的汤姆·里德尔是个英俊、聪明但冷漠且善于操纵的男孩。他已经发现了自己的魔法能力，并用它来恐吓其他孩子。邓布利多告诉他，他是一名巫师，并为他提供了霍格沃茨的一个位置。里德尔很兴奋，但拒绝了邓布利多的帮助，宁愿独自前往对角巷。邓布利多警告他不要偷窃。这段记忆揭示了里德尔早期的残忍、他渴望与众不同的心态，以及他对麻瓜父亲的蔑视。邓布利多注意到里德尔有收集受害者战利品的倾向。
格兰芬多对斯莱特林魁地奇比赛当天
福灵剂
魁地奇比赛当天早上，哈利偷偷假装往罗恩的南瓜汁里加了福灵剂，以增强他的信心。罗恩表现出色，扑救了每一个球，格兰芬多队大获全胜。比赛结束后，赫敏质问哈利，指责他使用了药剂，但哈利透露他实际上并没有使用；罗恩的成功是他自己的。胜利的庆祝被罗恩与拉文德·布朗的新恋情破坏了，他在赫敏面前炫耀。赫敏又伤心又生气，变出一群金丝雀攻击罗恩，然后愤然离去。这件事加深了罗恩和赫敏之间的裂痕。
斯拉格霍恩圣诞晚会的当晚
牢不可破的誓言被揭露
在斯拉格霍恩的圣诞晚会上，哈利注意到德拉科·马尔福试图不请自来。斯内普把马尔福拉到一边私下交谈。哈利用隐形衣跟着并偷听。他听到斯内普主动提出帮助马尔福，并透露他与纳西莎立下了牢不可破的誓言，要保护马尔福，并在马尔福失败时替他完成任务。马尔福拒绝了斯内普的帮助，坚称自己有计划，不需要干涉。他指责斯内普想抢他的功劳。这段对话证实了哈利的怀疑：马尔福正在为伏地魔执行一项任务，而斯内普也深深卷入其中，尽管他的真实忠诚仍不明朗。
在陋居的圣诞假期
一个非常冷淡的圣诞节
哈利在陋居与韦斯莱一家共度圣诞节。假期气氛紧张，珀西·韦斯莱与新任魔法部部长鲁弗斯·斯克林杰短暂来访。斯克林杰把哈利拉到一边私下谈话，要求他成为魔法部的希望象征，并给人留下他与魔法部合作的印象。哈利拒绝了，并批评了魔法部的行为，例如监禁斯坦·桑帕克。斯克林杰指责哈利是“彻头彻尾邓布利多的人”，哈利自豪地承认了。谈话陷入僵局。哈利还了解到更多关于莱姆斯·卢平在狼人中执行危险任务的情况，以及芬里尔·格雷伯克的威胁。
一个周一的晚上，哈利与邓布利多的第三次私人课程期间
一段被篡改的记忆
邓布利多向哈利展示了霍拉斯·斯拉格霍恩的一段被篡改的记忆。在原始记忆中，年轻的汤姆·里德尔向斯拉格霍恩询问魂器。斯拉格霍恩神色不安地解释说，魂器是一种巫师用来隐藏自己灵魂碎片的物品，通过谋杀来实现。里德尔接着问，制作多个魂器是否会更好，特别是七个，这是最具魔力的数字。斯拉格霍恩吓坏了，匆匆结束了谈话。邓布利多解释说，斯拉格霍恩篡改了记忆以掩盖他的羞愧。他交给哈利一个任务：从斯拉格霍恩那里获取真实、未经篡改的记忆，因为这对理解伏地魔的计划至关重要。
罗恩的生日，三月一日
生日惊喜
在罗恩生日那天，哈利不小心给了罗恩一盒被罗米达·万尼下了迷情药的巧克力坩埚。罗恩迷上了罗米达，并在哈利试图解释时攻击了他。哈利用倒挂金钟咒制服了他，然后带他去找斯拉格霍恩要解药。在那里，斯拉格霍恩请他们喝了一杯橡木陈酿蜂蜜酒。罗恩喝下后立刻中毒。哈利将一颗牛黄塞进罗恩喉咙，救了他的命。这是一次近乎致命的袭击，哈利怀疑毒药原本是针对邓布利多或斯拉格霍恩本人的。罗恩住院治疗，但康复了。
罗恩中毒后的当晚
家养小精灵的尾巴
哈利、赫敏和金妮去校医院看望罗恩。他们讨论了中毒事件和之前凯蒂·贝尔遇袭事件，得出结论，这两次很可能都是针对邓布利多的谋杀企图。海格透露，邓布利多与斯内普发生过激烈争吵，这让哈利深感怀疑。后来，哈利派克利切和多比跟踪德拉科·马尔福。他们报告说，马尔福定期前往七楼，进入一个房间，并有其他学生把守。哈利意识到马尔福在使用有求必应屋。他决心查明马尔福在那里做什么，尽管赫敏表示怀疑。
一个周一的晚上，哈利与邓布利多的第四次私人课程期间
伏地魔的请求
邓布利多向哈利展示了另外两段记忆。第一段来自家养小精灵霍基，显示伏地魔（当时还是汤姆·里德尔）在博金-博克商店工作，并拜访了富有的女巫赫普兹巴·史密斯。他迷惑了她，让她给他看了赫奇帕奇的金杯和斯莱特林的挂坠盒，随后他偷走了它们，谋杀了她，并嫁祸给霍基。第二段记忆是邓布利多自己的，显示了一次后来的会面，当时伏地魔已成为强大的黑巫师，他请求在霍格沃茨担任黑魔法防御术教职。邓布利多知道伏地魔的真实意图，拒绝了他。会面以伏地魔的愤怒和邓布利多的悲伤告终。邓布利多解释说，伏地魔很可能用重要的魔法物品制作了多个魂器。
中毒事件几周后，春季学期期间
无法知晓的房间
哈利多次试图进入有求必应屋监视马尔福，但都失败了，因为他不知道马尔福用它来做什么。他遇到了唐克斯，她看起来情绪低落，正在找邓布利多。哈利还上了一节紧张的黑魔法防御术课，斯内普嘲笑罗恩不会幻影移形。后来，哈利和罗恩讨论了马尔福的活动。哈利意识到马尔福正在使用复方汤剂把克拉布和高尔伪装成其他学生充当哨兵。他决心找到进入房间的方法，但赫敏建议他转而专注于从斯拉格霍恩那里获取记忆。
晚春的一个晚上
葬礼之后
哈利收到海格的便条，请他参加阿拉戈克的葬礼。他决定使用福灵剂来帮助他从斯拉格霍恩那里获取记忆。在药剂的影响下，他强烈感到要去海格那里。在那里，他找到了斯拉格霍恩，他是来收集八眼巨蛛毒液的。哈利操纵了局面，经过一夜的饮酒和交谈，他唤起了斯拉格霍恩的内疚和恐惧。他提醒斯拉格霍恩他母亲的牺牲以及他自己作为被选中的人的命运。最后，斯拉格霍恩情绪激动，从自己脑海中提取出真实的记忆交给了哈利。任务成功了。
同一天深夜，在邓布利多的办公室
魂器被揭露
哈利把真实的记忆带给邓布利多。他们一起观看，看到了汤姆·里德尔询问斯拉格霍恩关于制作多个魂器的完整对话。邓布利多证实了他的理论：伏地魔一直在将自己的灵魂分裂成七份，制作了六个魂器。他透露他已经摧毁了两个：汤姆·里德尔的日记和马沃罗·冈特的戒指。他相信剩下的魂器是赫奇帕奇的金杯、斯莱特林的挂坠盒、蛇纳吉尼，以及可能一件来自拉文克劳或格兰芬多的物品。邓布利多告诉哈利，他一直在寻找它们，并且很快就能找到另一个。他承诺找到时会带哈利一起去。
魁地奇决赛前几天
神锋无影
哈利仍然无法进入有求必应屋，偶然发现德拉科·马尔福在盥洗室里哭泣。马尔福透露他对自己的任务感到恐惧，担心如果失败伏地魔会杀了他。一场决斗爆发了，哈利在恐慌中使用了混血王子书中的一个未知咒语：神锋无影。咒语划开了马尔福的脸和胸膛，造成严重出血。斯内普赶到并治好了马尔福，然后要求查看哈利的课本。哈利把自己的《高级魔药制作》课本换成了罗恩的，但斯内普在里面发现了“罗恩·韦斯莱”的名字，知道这不是哈利的书。斯内普罚哈利本学期每个周六关禁闭，使他无法参加魁地奇决赛。
邓布利多去世的前一晚
被偷听的先知
哈利被叫到邓布利多的办公室。路上，他发现了特里劳妮教授，她被一个神秘的、庆祝的声音从有求必应屋里赶了出来。她提到她当时正试图藏起她的雪利酒瓶。哈利意识到马尔福一定在里面，正在庆祝他任务的完成。特里劳妮随后透露了一个关键信息：是西弗勒斯·斯内普偷听到了预言，并将其传给了伏地魔。哈利怒不可遏，与邓布利多对质，邓布利多证实了斯内普过去的错误，但坚称他完全信任斯内普。邓布利多随后告诉哈利，他们要去取一个魂器，哈利同意服从他的命令。
邓布利多去世当晚
岩洞试炼
邓布利多和哈利幻影移形到一个海边洞穴。他们通过一条隐藏通道进入，发现一个巨大的地下湖，湖中央有绿光。邓布利多召唤了一条船，他们渡到一个小岛上。在那里，他们发现了一个装满药剂的石盆。邓布利多断定必须喝掉药剂才能拿到底部的魂器。他喝下了药剂，这给他带来了巨大的痛苦和折磨，迫使哈利不得不让他继续喝。邓布利多喝完后，他们从石盆里取出了一个挂坠盒。当他们离开时，阴尸发动了攻击，但邓布利多使用火焰击退了它们。他们逃出了洞穴，但邓布利多严重虚弱。
从洞穴返回后立即
被闪电击中的塔楼
哈利和邓布利多幻影移形到霍格莫德，在那里他们看到霍格沃茨上空有黑魔标记。他们飞向天文塔，德拉科·马尔福在那里与邓布利多对峙。邓布利多平静地与马尔福交谈，透露他知道马尔福的任务，并提出保护他。马尔福犹豫了，但随后食死徒们，包括芬里尔·格雷伯克，赶到了。斯内普出现了，邓布利多向他恳求。斯内普带着厌恶和仇恨的表情，向邓布利多施放了杀戮咒阿瓦达索命，将他炸下了塔楼。哈利被邓布利多自己的咒语定住，被迫目睹这一切。食死徒们逃走了，哈利现在自由了，追赶着他们。
邓布利多死后立即
王子的逃亡
哈利追逐斯内普和马尔福穿过城堡，来到场地。他与斯内普对峙，斯内普透露自己是混血王子。斯内普嘲笑哈利和他的父亲，随后展开决斗。斯内普轻松挡开哈利的咒语，短暂挣扎后，在学校边界外幻影移形。哈利感到崩溃和愤怒。他返回天文塔脚下，发现邓布利多的尸体。他还发现他们取回的挂坠盒是假的，里面有一张署名R.A.B.的纸条，声称偷走了真正的魂器。这一夜以悲剧和混乱告终。
邓布利多去世当晚及随后几天
凤凰的哀歌
在校医院，哈利、罗恩、赫敏和其他人了解了战斗的全貌。比尔·韦斯莱被芬里尔·格雷伯克袭击，留下严重伤疤，但芙蓉仍坚持要嫁给他。唐克斯透露她对莱姆斯·卢平的爱意，卢平因狼人身份起初拒绝了她。麦格教授成为代理校长，并讨论关闭霍格沃茨的可能性。哈利被问及与邓布利多的活动，但拒绝透露任何信息。他独自面对假魂器，深知必须继续使命。凤凰福克斯唱起哀歌，随后永远离开了霍格沃茨。
邓布利多葬礼当天
白色坟墓
在一个晴朗的夏日，邓布利多的葬礼在霍格沃茨举行。大批人群聚集，包括学生、教职员工、魔法部官员和魔法生物。海格将邓布利多裹在紫色天鹅绒中的遗体抬到大理石桌上。悼词结束后，邓布利多的遗体被白色火焰吞噬，原地出现一座白色大理石坟墓。马人和人鱼致以敬意。葬礼后，哈利告诉金妮他们必须结束关系以保护她免受伏地魔伤害。他还告诉罗恩和赫敏，他不会返回霍格沃茨，计划追查剩余的魂器。他们发誓与他同行。
