二磷酸腺苷

二磷酸腺苷是在三磷酸腺苷转移末端磷酸基团、为肌肉收缩提供动力时产生的二磷酸形式。它不只是这一转移过程留下的残余物——书中描述了一个持续循环，其中二磷酸腺苷与游离磷酸基团结合，恢复为三磷酸腺苷，将细胞的能量供应与氧化过程联系起来。

形成并恢复为三磷酸腺苷

在收缩的肌细胞中，三磷酸腺苷放出一个磷酸基团时，能量便得以释放。随后，分子保留两个磷酸基团，成为二磷酸腺苷。循环继续时，另一个磷酸基团与二磷酸腺苷结合，使其恢复为能量更强的三磷酸腺苷。这一过程表明，能量转移是循环往复的过程，而非储能的一次性消耗。

细胞能量循环

书中将三磷酸腺苷比作充满电的蓄电池，将二磷酸腺苷比作放电后的蓄电池。这一比喻强调了两种形式之间可逆的关系——三磷酸腺苷释放一个磷酸基团，提供可用能量；磷酸基团的加入则使二磷酸腺苷重新获得能量。三磷酸腺苷的恢复与氧化过程相偶联；这种紧密联系称为偶联磷酸化。

偶联失效时

这一循环也阐明了解偶联的后果。如果氧化过程继续进行，却没有磷酸化过程将二磷酸腺苷与游离磷酸结合、恢复为三磷酸腺苷，细胞便失去了提供可用能量的途径。因此，书中的论述将二磷酸腺苷置于核心位置，不是把它视为孤立的分子，而是视为连接细胞呼吸与可供细胞做功的能量这一过程中的一种状态。