遗传记忆
群Yrr跨世代的基因组记忆被提出作为该物种集体学习的基础——信息储存在细胞的脱氧核糖核酸中，通过突变发生改变，并被复制到新细胞中，因此早期世代的经验仍可供集体调用。这一概念呈现的Yrr，不只是更聪明的对手，更是一种生命形式，其记忆、身份和行动能力分布于细胞与地质时间之中。
从化学信号到学习型集体
细胞集体行为的可能性，首先通过与细菌的比较变得可以理解。苏·奥利维拉描述了饥饿的黄色黏球菌细胞如何释放化学信号；随着信号增强，菌群聚集成子实体。这个例子表明，细胞能够通过化学作用彼此协调并组装成更大的结构，尽管它本身并未解释这种结构如何能够思考或学习。
这一更难的问题启发了凯伦·韦弗关于计算机模型的研究。她和莱昂·阿纳瓦克描述了如何为虚拟变形虫编入会持续突变的电子脱氧核糖核酸。在他们的模型中，细胞能够通过脱氧核糖核酸的变化进行学习；当这些学习单元重新组合时，计算机的神经网络功能也会恢复。模型还让细胞能够在模拟的深海环境中于三维空间移动，其中包括压力、水流和摩擦。这项工作试图让分布式细胞系统变得可以理解，并非声称普通单细胞生物独自拥有类似人类的心智。
提出的Yrr机制将化学交流与遗传变异结合起来。信息素帮助细胞彼此识别，而Yrr遗传物质中细小且高度易变的区域，则被认为能够标记一个细胞属于哪个集体。这些区域必须在细胞形成之后发生变化。在这一解释中，化学信号传递协调活动，而脱氧核糖核酸的变异与遗传，则提供了持久保留并传递集体所学内容的方式。
通过细胞分裂传递的记忆
西古尔·约翰森通过细胞层面的繁殖，解释了与人类记忆的关键差异。当一个Yrr细胞吸收信息并分裂时，它会连同储存在基因组中的信息一并复制。因此，它的后继细胞继承的不只是抽象记录——它获得经验的方式，仿佛自己曾亲历那些事件。每个新细胞都加入一个其历史已由遗传物质承载的集体。
相比之下，人类知识依赖个体心智，以及言语、文字和图像等外部保存手段。新生儿并不具备早期世代的亲身经验，而个体死亡也会终结其记忆。记录可以保存叙述，却不能让后人直接体验叙述背后的经历。约翰森的比较使这种差异具体可见——人类必须亲自从遭遇中学习，而Yrr细胞能够继承早期细胞的遭遇经验。
这种遗传记忆也支撑着持续学习，而不只是简单重复。集体会比较过去的结果，修改并改进策略，从错误中学习，并将这些调整传递下去。在约翰森的解释中，即使失败的方法也会作为知识保留下来；新细胞无需重犯错误，就能知道其后果。因此，记忆是用于筛选、适应和行动的工作资源，而不仅是储存过去的仓库。
地质时间与人类的局限
小说将这一理念从生物世代延伸至地球历史。据称，Yrr在侏罗纪初期、约两亿年前获得意识，此后一直保留知识。它们继承的记录涵盖了大陆与海盆格局的变化——大洋板块与如今称为北美洲的陆块相接、格陵兰与欧洲分离，以及大西洋地形的形成。这些并非由某个长寿个体持有的记忆，而是被描述为通过细胞集体的延续传递下来的信息。
韦弗后来的思考将这种时间跨度与人类狭窄的时间视野相对照。人类心智受以眼前生存为导向的进化历史塑造，往往只关注不久的将来；灾难可能被遗忘或化为神话，而社会也一再未能顾及遥远世代采取行动。文段将遗忘描述为一种曾有助于生存、如今却成了负担的特性——缺乏关于后果的共同可靠记忆，人们便难以看见自己置身其中的更大系统。
水粒子穿越全球海洋输送带的意象，为这种对比赋予了具体尺度。这段旅程连接格陵兰海盆、大西洋以及流向南极洲的海域；完整循环需要一千年。按照叙述中的解释，Yrr继承的知识包括这些洋流的历史及其维持条件。它们让湾流停止，终结了湾流对欧洲的增温作用。这个行动并未被呈现为意外的附带结果，而是Yrr凭借对相互关联系统的记忆所理解的后果。
在冲突中的意义
基因记忆使Yrr的战略优势与其存在形式密不可分。约翰森认为，要击败它们，就必须消灭集体中最后一个成员；然而，它们的细胞网络范围尚不明确，且可能延伸至极远之处。它们的力量不仅来自数量——一个细胞死亡，信息也不会随之消失；策略能够不断积累和修订，其时间跨度超出一般人类规划所及。
这一概念也动摇了人类的假设——记忆属于彼此分离的个体，智能必定集中于单个大脑之中。在小说里，Yrr的认知产生于交流、细胞遗传和集体比较。它们的记忆使其能够着眼长远，而人类的制度和个体却一再无法维持这种视野。因此，这场冲突也成为不同时间观之间的较量——一个物种每一代都重新开始，另一个物种则将过去作为其活体生物系统的一部分延续下去。
