总司令部

总司令部在指挥链中位于701部队之上，并直接监督敏感的密码行动。其职责通过两个颇具揭示性的事件展现出来——荣金珍的笔记本失踪后，事件被紧急上报；以及总司令部直接控制破译PURPLE密码体系的工作，在这一行动中，集中管控也意味着有意对部分官员隐瞒信息。

指挥链中的位置

荣金珍的笔记本在火车上失踪后，瓦西里通知了列车安保人员，并通过电报向701部队报告。701部队将报告转交总司令部，总司令部又逐级上报，直至最高级别的主管下达命令。指令将失踪文件定为国家安全事项，并要求所有部门尽一切必要努力，尽快找回文件。因此，总司令部展现为一个指挥环节，能够将局部损失转化为各部门优先处理的事项；但叙述并未透露其上级的具体层级。

对PURPLE密码体系行动的控制

总司令部还直接负责破译PURPLE密码体系的工作。郑主任解释说，他当时在海外学习另一个国家处理这种密码的经验，期间利谢维奇与他取得联系；他回国后却没有看到这些信件。负责破译PURPLE密码体系的特别工作组独自掌握这些信件的第一手信息，组织中的其他人则被蒙在鼓里。郑主任推测，总司令部或许担心官员们会争相竞争，看谁能拿出所期望的成果。这一说法被呈现为他的推测，但材料受到限制传阅一事则十分明确。

档案、阅览权限与保密

扬·利谢维奇与701部队之间的通信使用英语，并附有中文译文。很久以后，总司令部的一位高级官员才允许郑主任查看这些信件。档案打开时，英文原件与译文分开放置，一份电话谈话记录则列在最前面，作为案卷的序言。迟来的阅览许可和经过仔细编排的文件表明，这一机构对信息的控制不仅体现在行动决策中，也体现在档案的保管与发放方式上。

机构影响力与证据局限

叙述表明，总司令部既是紧急安全危机的上报节点，也是指挥重大密码破译行动的权威机构。叙述没有说明其上级的完整指挥结构，也没有将与密码案件相关的监视或软禁直接归于总司令部。其重要性体现在两种情形的对照之中——国家安全文件遗失时，相关部门迅速广泛动员；秘密行动进行时，信息的阅览权限却受到严格限制。